Dalam upaya mencetak generasi yang cerdas secara akademik, tangguh, dan berakhlak mulia, SD Plus Citra Madinatul Ilmi menerapkan sistem pendidikan yang komprehensif dan adaptif. Kurikulum yang diampu di sekolah ini merupakan perpaduan harmonis antara Kurikulum Merdeka nasional dengan Kurikulum Bermuatan Plus Islami yang dirancang secara khusus oleh Yayasan Citra Babur Rahman Madinatul Ilmi.

Penerapan Kurikulum Merdeka memberikan keleluasaan bagi peserta didik untuk belajar sesuai dengan minat, bakat, dan kecepatan belajar mereka (differentiated learning), dengan fokus utama pada penguatan literasi, numerasi, serta pengembangan Profil Pelajar Pancasila.

Sementara itu, kekhasan lembaga diperkuat melalui Kurikulum Bermuatan Plus Islami khas Yayasan Citra Babur Rahman Madinatul Ilmi. Kurikulum ini diintegrasikan secara mendalam ke dalam kegiatan intrakurikuler maupun ekstrakurikuler, dengan penekanan pada:

1. Penanaman akidah, akhlakul karimah, dan nilai-nilai keislaman dalam keseharian.
2. Pembiasaan ibadah praktis dan hafalan Al-Qur'an (tahfidz).
3. Integrasi sains dan pengetahuan umum dengan sudut pandang nilai-nilai Islam.

Melalui sinergi kurikulum ini, SD Plus Citra Madinatul Ilmi berkomitmen untuk menghadirkan lingkungan belajar yang tidak hanya memfasilitasi kecerdasan intelektual dan kemandirian siswa, tetapi juga membentengi mereka dengan fondasi spiritual dan karakter Islami yang kuat guna menghadapi tantangan zaman.